MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 9886

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_011989	GGC	2	6	2294946	2294951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_011989	GGT	2	6	2294964	2294969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_011989	GGC	2	6	2294994	2294999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_011989	GCA	2	6	2295074	2295079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_011989	CAC	2	6	2295105	2295110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6006	NC_011989	CCG	2	6	2295176	2295181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6007	NC_011989	CGC	3	9	2295182	2295190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6008	NC_011989	GGCCG	3	15	2295191	2295205	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6009	NC_011989	GCG	2	6	2295255	2295260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_011989	GTC	2	6	2295287	2295292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_011989	CG	3	6	2295329	2295334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6012	NC_011989	CGG	2	6	2295346	2295351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_011989	TCG	2	6	2295360	2295365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_011989	TCT	2	6	2295395	2295400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_011989	GGC	2	6	2295446	2295451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_011989	CGG	2	6	2295459	2295464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_011989	GCA	2	6	2295469	2295474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_011989	TGGG	2	8	2295498	2295505	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_011989	CGT	2	6	2295526	2295531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_011989	GGA	2	6	2295532	2295537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_011989	AGG	2	6	2295577	2295582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_011989	ATCC	2	8	2295612	2295619	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6023	NC_011989	TA	3	6	2295768	2295773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_011989	TGAG	2	8	2295850	2295857	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_011989	TCA	2	6	2295913	2295918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_011989	ATC	2	6	2296390	2296395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_011989	AT	3	6	2296471	2296476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_011989	CCT	2	6	2296563	2296568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6029	NC_011989	TCCC	2	8	2296961	2296968	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6030	NC_011989	AGTAA	2	10	2297024	2297033	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_011989	GCT	2	6	2297105	2297110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_011989	CCT	2	6	2297188	2297193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6033	NC_011989	CT	3	6	2297318	2297323	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6034	NC_011989	CAC	2	6	2297346	2297351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6035	NC_011989	CAA	2	6	2297354	2297359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_011989	A	6	6	2297358	2297363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_011989	TAG	2	6	2302592	2302597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_011989	GC	3	6	2302598	2302603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6039	NC_011989	CCGA	2	8	2302604	2302611	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6040	NC_011989	TCGAG	2	10	2302612	2302621	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6041	NC_011989	GA	3	6	2302695	2302700	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_011989	AATG	2	8	2302794	2302801	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_011989	AGCC	2	8	2302806	2302813	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6044	NC_011989	GTT	2	6	2302830	2302835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_011989	GAA	2	6	2302870	2302875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_011989	GAC	2	6	2302933	2302938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_011989	GAT	2	6	2303062	2303067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_011989	CCTT	2	8	2304260	2304267	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6049	NC_011989	CCT	2	6	2304775	2304780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6050	NC_011989	CT	3	6	2304797	2304802	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6051	NC_011989	CGCT	2	8	2304829	2304836	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6052	NC_011989	AC	3	6	2304837	2304842	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6053	NC_011989	TGAC	2	8	2304846	2304853	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6054	NC_011989	AGG	2	6	2304862	2304867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_011989	ACCC	2	8	2304887	2304894	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6056	NC_011989	ATGA	2	8	2307126	2307133	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_011989	GGA	2	6	2307134	2307139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_011989	ATC	2	6	2307145	2307150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_011989	T	6	6	2307207	2307212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_011989	AAT	2	6	2307841	2307846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_011989	GCA	2	6	2307995	2308000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_011989	CAT	2	6	2308007	2308012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_011989	GCA	2	6	2308429	2308434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_011989	GCA	2	6	2308461	2308466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_011989	GAC	2	6	2308473	2308478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_011989	CTT	2	6	2308493	2308498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6067	NC_011989	AGCCG	2	10	2308510	2308519	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6068	NC_011989	ACCG	2	8	2308560	2308567	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6069	NC_011989	GAGCC	2	10	2308600	2308609	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6070	NC_011989	TGC	2	6	2308639	2308644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6071	NC_011989	CAC	2	6	2308661	2308666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6072	NC_011989	GTG	2	6	2308673	2308678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_011989	AGA	2	6	2308741	2308746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_011989	GGAA	2	8	2308778	2308785	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_011989	ACG	2	6	2309842	2309847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6076	NC_011989	TGG	2	6	2309876	2309881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_011989	GCT	2	6	2309924	2309929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6078	NC_011989	A	7	7	2310035	2310041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_011989	A	8	8	2310056	2310063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_011989	A	6	6	2310074	2310079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_011989	AGC	2	6	2311049	2311054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6082	NC_011989	GCCA	2	8	2311055	2311062	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6083	NC_011989	CTTT	2	8	2311846	2311853	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6084	NC_011989	A	7	7	2312025	2312031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_011989	CGC	2	6	2312037	2312042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6086	NC_011989	GC	3	6	2312041	2312046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6087	NC_011989	CGT	2	6	2313803	2313808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6088	NC_011989	TGA	2	6	2313819	2313824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_011989	CA	3	6	2313834	2313839	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6090	NC_011989	AT	3	6	2313843	2313848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_011989	TAT	2	6	2313890	2313895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_011989	A	8	8	2313973	2313980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_011989	AGA	2	6	2313999	2314004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_011989	GTC	2	6	2314057	2314062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6095	NC_011989	TAT	2	6	2314142	2314147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_011989	CGA	2	6	2314172	2314177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6097	NC_011989	GCG	2	6	2315083	2315088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6098	NC_011989	C	7	7	2315132	2315138	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6099	NC_011989	A	7	7	2315264	2315270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_011989	A	7	7	2315366	2315372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_011989	CTATG	2	10	2316437	2316446	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6102	NC_011989	GTACG	2	10	2317145	2317154	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6103	NC_011989	GAA	2	6	2317211	2317216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_011989	TGA	2	6	2317222	2317227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_011989	GAA	2	6	2317231	2317236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_011989	AAG	2	6	2317300	2317305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_011989	GA	3	6	2317353	2317358	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_011989	GCC	2	6	2317381	2317386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6109	NC_011989	GGC	2	6	2318022	2318027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_011989	AAT	2	6	2318030	2318035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_011989	A	6	6	2318055	2318060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_011989	C	6	6	2318243	2318248	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6113	NC_011989	CTT	2	6	2318266	2318271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_011989	CAT	2	6	2318289	2318294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6115	NC_011989	CGC	2	6	2318310	2318315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6116	NC_011989	GTC	2	6	2318420	2318425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6117	NC_011989	CGC	2	6	2318588	2318593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6118	NC_011989	GAC	2	6	2318595	2318600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6119	NC_011989	CCCAA	2	10	2318609	2318618	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
6120	NC_011989	ATA	2	6	2318668	2318673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_011989	CATAA	2	10	2318695	2318704	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6122	NC_011989	TCC	2	6	2319045	2319050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6123	NC_011989	TTGT	2	8	2319051	2319058	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_011989	CCAAA	2	10	2319102	2319111	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
6125	NC_011989	GC	4	8	2319384	2319391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6126	NC_011989	ACC	3	9	2319561	2319569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6127	NC_011989	CGG	2	6	2319601	2319606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_011989	ACGA	2	8	2319618	2319625	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6129	NC_011989	GCA	2	6	2319632	2319637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6130	NC_011989	GTC	2	6	2319638	2319643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6131	NC_011989	CAG	2	6	2319644	2319649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6132	NC_011989	GAA	2	6	2319674	2319679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6133	NC_011989	CAT	2	6	2319684	2319689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6134	NC_011989	GCG	2	6	2319762	2319767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6135	NC_011989	TCC	2	6	2320252	2320257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6136	NC_011989	TCA	2	6	2320385	2320390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6137	NC_011989	CCA	2	6	2320391	2320396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6138	NC_011989	TTG	2	6	2321149	2321154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6139	NC_011989	T	6	6	2321166	2321171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6140	NC_011989	TAT	2	6	2321197	2321202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6141	NC_011989	GCG	2	6	2321844	2321849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6143	NC_011989	TCC	2	6	2321938	2321943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6144	NC_011989	TAA	2	6	2325182	2325187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6145	NC_011989	AT	3	6	2325203	2325208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6146	NC_011989	T	7	7	2325317	2325323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6147	NC_011989	CGG	2	6	2325378	2325383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6149	NC_011989	CTT	2	6	2325955	2325960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6152	NC_011989	ATA	2	6	2326016	2326021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6157	NC_011989	AACCG	2	10	2328106	2328115	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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6162	NC_011989	CAT	2	6	2328291	2328296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6164	NC_011989	ACC	2	6	2328357	2328362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6167	NC_011989	CGGTTC	2	12	2330978	2330989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6169	NC_011989	CAT	2	6	2331049	2331054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6200	NC_011989	GTG	2	6	2345966	2345971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6218	NC_011989	ACA	2	6	2348212	2348217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6240	NC_011989	TTCC	2	8	2359404	2359411	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6241	NC_011989	TTCCC	2	10	2359426	2359435	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
6242	NC_011989	T	7	7	2359449	2359455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6243	NC_011989	TAGA	2	8	2362114	2362121	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6244	NC_011989	CG	3	6	2363209	2363214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6245	NC_011989	CAC	2	6	2363244	2363249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6251	NC_011989	TGG	2	6	2364154	2364159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6253	NC_011989	CGG	2	6	2364190	2364195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6254	NC_011989	CGG	2	6	2364213	2364218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6255	NC_011989	GAA	2	6	2364230	2364235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6256	NC_011989	GGC	2	6	2364266	2364271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6257	NC_011989	TGA	2	6	2364302	2364307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6258	NC_011989	AGA	2	6	2364378	2364383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6259	NC_011989	GTGC	2	8	2364438	2364445	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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6393	NC_011989	CATTCA	2	12	2402436	2402447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6394	NC_011989	ATCCG	2	10	2402464	2402473	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6395	NC_011989	CCG	2	6	2402527	2402532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6396	NC_011989	TCG	2	6	2402537	2402542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6397	NC_011989	CAA	2	6	2402617	2402622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6398	NC_011989	TTTC	2	8	2402635	2402642	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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6401	NC_011989	GA	3	6	2402791	2402796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6419	NC_011989	TTCG	2	8	2408890	2408897	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6424	NC_011989	CGC	2	6	2410512	2410517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6432	NC_011989	CCG	2	6	2424536	2424541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6433	NC_011989	CA	3	6	2424564	2424569	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6434	NC_011989	AATG	2	8	2424791	2424798	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6462	NC_011989	CCGGA	2	10	2437603	2437612	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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6495	NC_011989	AAC	2	6	2448325	2448330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6496	NC_011989	ACAA	2	8	2448359	2448366	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6497	NC_011989	A	6	6	2448377	2448382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6500	NC_011989	TC	3	6	2450933	2450938	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

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